More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0067 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
455 aa  895  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  82.11 
 
 
447 aa  682  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  82.11 
 
 
447 aa  682  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  88.6 
 
 
456 aa  785  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  82.11 
 
 
447 aa  682  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  77.01 
 
 
468 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  62.56 
 
 
445 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  59.69 
 
 
457 aa  493  1e-138  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 
443 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  54.73 
 
 
438 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  51.63 
 
 
440 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 
435 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  51.15 
 
 
434 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  47.06 
 
 
477 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  50.92 
 
 
458 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  48.74 
 
 
448 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 
455 aa  355  7e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  50.82 
 
 
455 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  46.82 
 
 
473 aa  343  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 
501 aa  340  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  48.52 
 
 
440 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  48.05 
 
 
430 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 
476 aa  308  2e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  42.11 
 
 
473 aa  305  8e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  47.41 
 
 
442 aa  303  4e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.5 
 
 
456 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 
464 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 
436 aa  259  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  31.57 
 
 
443 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 
443 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 
443 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
464 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 
436 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
454 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 
446 aa  244  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
434 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 
458 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 
458 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 
434 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 
444 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
434 aa  234  2e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 
434 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 
453 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  29.26 
 
 
444 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 
434 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 
421 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.4182e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.03 
 
 
444 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 
440 aa  226  5e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 
434 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.92 
 
 
441 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.79 
 
 
461 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 
444 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 
444 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 
443 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 
440 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 
441 aa  220  4e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  35.02 
 
 
436 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 
430 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 
442 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 
414 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 
425 aa  215  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 
428 aa  213  8e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9064e-06 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 
448 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 
448 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
425 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 
443 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 
443 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.92 
 
 
438 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 
442 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 
450 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.55 
 
 
446 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 
431 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 
428 aa  203  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 
473 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  2.18323e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 
448 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 
420 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 
446 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 
446 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 
419 aa  198  2e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 
443 aa  198  2e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
438 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 
428 aa  196  5e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 
428 aa  196  5e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  31.24 
 
 
431 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 
422 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.58 
 
 
429 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 
451 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 
428 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 
416 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 
422 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.12 
 
 
465 aa  192  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 
420 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 
425 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 
408 aa  191  3e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  31 
 
 
429 aa  190  4e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>