More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl469 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 
604 aa  636  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
602 aa  636  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
598 aa  661  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  53.91 
 
 
602 aa  635  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 
608 aa  657  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
602 aa  636  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl469  GTP-binding membrane protein, elongation factor  100 
 
 
612 aa  1239  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.35836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
599 aa  654  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.09 
 
 
600 aa  657  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  53.64 
 
 
601 aa  663  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0210  GTP-binding protein TypA/BipA  80.72 
 
 
609 aa  1011  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.486829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 
601 aa  660  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.40002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 
602 aa  635  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
602 aa  635  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 
602 aa  664  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29587e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 
598 aa  669  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  53.64 
 
 
601 aa  665  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  52.91 
 
 
600 aa  632  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.08 
 
 
600 aa  632  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
606 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
603 aa  631  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 
614 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.78233e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 
605 aa  631  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  53.15 
 
 
615 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
615 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
608 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
608 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 
614 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
610 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.16376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.38 
 
 
610 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
615 aa  618  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
599 aa  615  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.38 
 
 
610 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  51.81 
 
 
602 aa  616  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 
609 aa  611  1e-174  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  51.84 
 
 
608 aa  612  1e-174  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 
603 aa  614  1e-174  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
602 aa  613  1e-174  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 
608 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
600 aa  610  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 
608 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
608 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 
608 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  51.65 
 
 
609 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
608 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  51.67 
 
 
609 aa  607  1e-172  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
606 aa  605  1e-172  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 
608 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
606 aa  608  1e-172  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  52.05 
 
 
606 aa  606  1e-172  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 
608 aa  606  1e-172  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
608 aa  603  1e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
608 aa  602  1e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
603 aa  602  1e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
603 aa  604  1e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.0951e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
608 aa  602  1e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 
610 aa  602  1e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
605 aa  604  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
608 aa  603  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 
615 aa  604  1e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.1 
 
 
613 aa  603  1e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  50.92 
 
 
607 aa  602  1e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 
606 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
605 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  51.34 
 
 
605 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
606 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  52.33 
 
 
608 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 
607 aa  601  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
615 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  49.75 
 
 
610 aa  599  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  51.24 
 
 
621 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 
606 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 
606 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  50.08 
 
 
615 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
608 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  52.03 
 
 
594 aa  601  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  50.83 
 
 
606 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 
615 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 
606 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 
608 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 
603 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  51 
 
 
603 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 
607 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 
609 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
606 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>