More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3188 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  97.81 
 
 		 411 aa  791    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  89.08 
 
 		 427 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 411 aa  812    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  52.87 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  40.35 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  38.52 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  39.48 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  35.57 
 
 		 450 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.63 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  39.67 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  35.39 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  35.36 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.95 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  34.49 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.43 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  33.43 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.08 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.96 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 517 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  42.93 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  42.34 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  34.18 
 
 		 638 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 632 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  35.62 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.33 
 
 		 585 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  31.11 
 
 		 632 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.04 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  36.9 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 735 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 		 591 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.57 
 
 		 678 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 515 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  36.84 
 
 		 614 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.26 
 
 		 483 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.26 
 
 		 483 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  39.44 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 		 712 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.53 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  36.08 
 
 		 645 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 643 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.11 
 
 		 518 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  39.5 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 		 858 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 		 859 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  33.77 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  35.95 
 
 		 645 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  35.93 
 
 		 969 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  33.33 
 
 		 577 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.64 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.86 
 
 		 971 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 		 864 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.17 
 
 		 701 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 		 740 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.73 
 
 		 757 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 546 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 		 643 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  29.32 
 
 		 701 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 		 652 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  30.77 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 675 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 		 861 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.41 
 
 		 656 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  30.77 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.81 
 
 		 513 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 		 744 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 665 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.09 
 
 		 756 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 		 746 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 		 532 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.59 
 
 		 753 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  29.75 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 860 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 		 564 aa  87  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  34.68 
 
 		 571 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 		 656 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.39 
 
 		 701 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>