More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0223 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  73.36 
 
 		 558 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  61.76 
 
 		 558 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  67.65 
 
 		 545 aa  755    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  96.8 
 
 		 563 aa  1089    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  66.67 
 
 		 535 aa  734    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  74.16 
 
 		 558 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  99.29 
 
 		 563 aa  1117    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  62.34 
 
 		 540 aa  692    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  63.83 
 
 		 552 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 563 aa  1122    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  75.51 
 
 		 557 aa  821    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  83.48 
 
 		 565 aa  952    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  65.41 
 
 		 544 aa  730    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  61.24 
 
 		 548 aa  697    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  63.6 
 
 		 554 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 564 aa  602  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  53.8 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  54.24 
 
 		 555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  53.73 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  53.19 
 
 		 554 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  53.19 
 
 		 554 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  54.77 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  52.65 
 
 		 542 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  54.37 
 
 		 541 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  53.18 
 
 		 541 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  51.46 
 
 		 539 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  53.73 
 
 		 541 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  53.46 
 
 		 541 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  53.85 
 
 		 543 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  53.53 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  52.33 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 		 555 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  52.48 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 		 555 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  52.94 
 
 		 528 aa  522  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  52.82 
 
 		 542 aa  525  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.36 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  45.17 
 
 		 590 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.83 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  45.28 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  44.84 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.08 
 
 		 575 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  43.95 
 
 		 558 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.88 
 
 		 564 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  44.42 
 
 		 548 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 		 541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  43.13 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  45.3 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.86 
 
 		 560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  44.38 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  44.23 
 
 		 541 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  44.09 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  42.7 
 
 		 615 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  44.27 
 
 		 554 aa  442  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  42.75 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.25 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.95 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  44.47 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.37 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.31 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.37 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  43.83 
 
 		 806 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  45.27 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.03 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 		 638 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  40.99 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  42.88 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  41.41 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.32 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  45.32 
 
 		 561 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  43.84 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  42.5 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  43.98 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  44.51 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  42.18 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  43.65 
 
 		 563 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  40.8 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  38.72 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  40.22 
 
 		 555 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  42.5 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  42.77 
 
 		 535 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.69 
 
 		 527 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.19 
 
 		 560 aa  415  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  42.21 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  43.44 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  41.94 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  42.24 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  43.04 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  43.4 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  41.52 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  42.11 
 
 		 530 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.91 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  42.11 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  44.25 
 
 		 596 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  41.94 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  41.94 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>