71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0281 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  67.48 
 
 		 182 aa  247  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  65.66 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  61.83 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  59.56 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  65.64 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  65.64 
 
 		 222 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 		 181 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  63.31 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  60.82 
 
 		 190 aa  234  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  61.54 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  64.07 
 
 		 180 aa  230  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  66.05 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  58.38 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  60.25 
 
 		 187 aa  220  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  55.21 
 
 		 175 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 		 260 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 369 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  35.51 
 
 		 265 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 		 265 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  37.18 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  37.98 
 
 		 302 aa  85.9  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 		 229 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  36.05 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  36.64 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  36.64 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  38.03 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  34.09 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  35.92 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  35.63 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  34.69 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  32.75 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  32.31 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  28.08 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.38 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  30.16 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  28.07 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  30.16 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  30.92 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  30.19 
 
 		 265 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  31.88 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.08 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  29.01 
 
 		 216 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  27.97 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  25.71 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  26.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1364  lytic transglycosylase, catalytic  28.33 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0515588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  31.91 
 
 		 340 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  27.2 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 330 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 211 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>