More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1964 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  73.86 
 
 		 441 aa  688    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  72.89 
 
 		 437 aa  668    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 443 aa  900    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  78.41 
 
 		 440 aa  711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  69.91 
 
 		 446 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  62.59 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  60.63 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  59.14 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.91 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.85 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.92 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.38 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  49.42 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  52.49 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  48.48 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  48.6 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  48.01 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.65 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  48 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.37 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  43.58 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  41.84 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  42.79 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.62 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  39.81 
 
 		 449 aa  326  6e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  42.07 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.61 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  40.38 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  36.02 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.55 
 
 		 510 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  37.83 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  38.17 
 
 		 591 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  36.63 
 
 		 561 aa  286  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  39.59 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  38.81 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.71 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  36.77 
 
 		 542 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  34.55 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  38.61 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  37.12 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  37.07 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  38.22 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.13 
 
 		 490 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.5 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  36.12 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  36.51 
 
 		 450 aa  269  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  37.21 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  36.99 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  36.66 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.16 
 
 		 551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  36.79 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  36.87 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  36.79 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  35.18 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  36.43 
 
 		 476 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.11 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.95 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  37.29 
 
 		 446 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3386  signal recognition particle protein  37.21 
 
 		 550 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.44 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  36.14 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.53 
 
 		 481 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3450  signal recognition particle protein  37.21 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.279897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.89 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  36.57 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  37.21 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.67 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3307  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.99 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  36.53 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  36.55 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.55 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  36.09 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  35.8 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  35.8 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  37.39 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  35.17 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  37.44 
 
 		 489 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  35.83 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  35.47 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  36.03 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  35.57 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  37.17 
 
 		 458 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  35.63 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  35.57 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  36.61 
 
 		 485 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  35.42 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  35.12 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.94 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.68 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  35.33 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  36.97 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  37.05 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  35.05 
 
 		 512 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>