More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0038 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  822  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  64.62 
 
 
419 aa  501  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  67.08 
 
 
418 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
416 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 
421 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  44.59 
 
 
391 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.43521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 
408 aa  284  2e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  45.08 
 
 
404 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  35.34 
 
 
418 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  34.65 
 
 
397 aa  196  8e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
424 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
421 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  31.88 
 
 
412 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.14 
 
 
408 aa  174  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  35 
 
 
442 aa  172  8e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  33.08 
 
 
411 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  32.38 
 
 
430 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
425 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
430 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.43 
 
 
413 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
429 aa  167  3e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  30.9 
 
 
422 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
433 aa  166  7e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  31.17 
 
 
401 aa  165  1e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.02 
 
 
402 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  31.14 
 
 
424 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  30.22 
 
 
412 aa  163  4e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
407 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
411 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  32.32 
 
 
410 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.54 
 
 
402 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
407 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
407 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  30.73 
 
 
400 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
453 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.05 
 
 
402 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 
402 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 
402 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
453 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
415 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.54 
 
 
402 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.29 
 
 
402 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  32.69 
 
 
421 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
421 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  30.98 
 
 
400 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
421 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  30.98 
 
 
400 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  35.32 
 
 
442 aa  154  3e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  30.73 
 
 
400 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  30.73 
 
 
400 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  30.73 
 
 
400 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  31.39 
 
 
412 aa  153  6e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.77663e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  30.73 
 
 
400 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  32.61 
 
 
431 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  30.54 
 
 
406 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  31.37 
 
 
475 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.93 
 
 
400 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  32.15 
 
 
410 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
405 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.68 
 
 
400 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  32.85 
 
 
437 aa  148  1e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
467 aa  146  7e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  32.4 
 
 
412 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
437 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  31.29 
 
 
467 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
405 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
436 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
398 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
398 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
398 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
398 aa  141  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
398 aa  141  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  30.67 
 
 
467 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  29.08 
 
 
424 aa  140  4e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  30.14 
 
 
429 aa  140  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  30.14 
 
 
429 aa  140  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  29.53 
 
 
432 aa  140  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
432 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
436 aa  139  8e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  29.29 
 
 
436 aa  139  9e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
432 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
393 aa  137  3e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  29.27 
 
 
553 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  29.21 
 
 
433 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.71 
 
 
402 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  31.03 
 
 
455 aa  135  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  30.15 
 
 
467 aa  135  1e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  28.54 
 
 
425 aa  135  2e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
441 aa  135  2e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.89 
 
 
404 aa  132  8e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  27.85 
 
 
437 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  27.08 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  27.08 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  27.08 
 
 
400 aa  131  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  27.35 
 
 
402 aa  131  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  27.08 
 
 
402 aa  130  4e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  27.08 
 
 
400 aa  130  4e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>