206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0408 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  100 
 
 		 377 aa  773    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  78.08 
 
 		 530 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  64.63 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.94 
 
 		 533 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  64.96 
 
 		 528 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  55.48 
 
 		 537 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  54.25 
 
 		 543 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  53.55 
 
 		 543 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  54.25 
 
 		 543 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  45.06 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.35 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  52.91 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.94 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  51.34 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  48.94 
 
 		 526 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  56.08 
 
 		 543 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  30.82 
 
 		 717 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0532  hypothetical protein  28.5 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  33.79 
 
 		 531 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  34.59 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  34.59 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.34 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.41 
 
 		 504 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  33.13 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  32.3 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  32 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  32 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  32 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  27.4 
 
 		 508 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  32 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  32 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  32 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.25 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  34.75 
 
 		 518 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  31.06 
 
 		 503 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  29.17 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  29.86 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  32.88 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  29.17 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  29.17 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  31.06 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  31.06 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  31.68 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  31.06 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  31.06 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  29.17 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  30.32 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  31.68 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  31.54 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  31.33 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  30.14 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  31.33 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  34.27 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.47 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.68 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3408  sodium/proline symporter  30.07 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704891  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  34.04 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4063  sodium/proline symporter  30.07 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  34.03 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  30.14 
 
 		 488 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  32.24 
 
 		 496 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  30 
 
 		 492 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  34.81 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  34.81 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  34.81 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  30.06 
 
 		 484 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05050  sodium/proline symporter  29.21 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  29.81 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  29.68 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4423  sodium/proline symporter  30.46 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4236  sodium/proline symporter  30.46 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0117  sodium/proline symporter  30.46 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  30.92 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  30.92 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  29.38 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  29.81 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  29.81 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  29.38 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  31.33 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  29.38 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  36.08 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  33.33 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  36.08 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  30 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  36.08 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  36.08 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4283  sodium/proline symporter  29.8 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>