More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05050  sodium/proline symporter  100 
 
 		 499 aa  971    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  64.3 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  62.47 
 
 		 544 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04170  sodium/proline symporter  60.72 
 
 		 499 aa  569  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0302673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  52.89 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  52.69 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  52.89 
 
 		 492 aa  548  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  52.89 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  52.69 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  52.89 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  54.49 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  52.2 
 
 		 492 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  52.71 
 
 		 492 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  52.72 
 
 		 492 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  51.99 
 
 		 492 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  54.73 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  55.35 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  52.97 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  53.17 
 
 		 487 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  52.76 
 
 		 492 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  52.56 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  52.76 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  52.76 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  52.97 
 
 		 492 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  52.56 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  52.76 
 
 		 492 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  52.76 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  51.61 
 
 		 488 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29910  sodium/proline symporter  60.68 
 
 		 520 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  51.54 
 
 		 486 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2670  sodium/proline symporter  49.81 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  51.56 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  50.4 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  50.71 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  49.4 
 
 		 506 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  49.6 
 
 		 493 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  49.21 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  48.85 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  46.91 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  47.7 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  48.57 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  46.51 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  49.9 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  49.07 
 
 		 483 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  50.7 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  48.83 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  48.62 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  49.09 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  47.98 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  47.52 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  46.89 
 
 		 504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  50.7 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  48.59 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  48.3 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  47.72 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  49.6 
 
 		 492 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  48.2 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  47.08 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  48.41 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  49.07 
 
 		 483 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  49.49 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  48.75 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  48.39 
 
 		 492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  47.81 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  47.42 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  47.59 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  47.42 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  47.42 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  47.42 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  47.2 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  46.93 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  47.23 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  49.09 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  47.22 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  48.54 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  46.93 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2039  proline permease  46.6 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2265  sodium/proline symporter  46.6 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  49.29 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2367  sodium/proline symporter  46.6 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  47.46 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  47.87 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01675  proline/sodium symporter  46.39 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.068924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  47.5 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4147  sodium/proline symporter  46.2 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  45.36 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5016  proline permease  48.41 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1731  sodium/proline symporter  45.86 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.253035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  48.62 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  44.08 
 
 		 488 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>