More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3010 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 414 aa  823    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  59.19 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  42.23 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  40.56 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  41.76 
 
 		 414 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  39.63 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  32.51 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  34.98 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  33.9 
 
 		 397 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.53 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  33.74 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  32.69 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.01 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.71 
 
 		 653 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  32.76 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  31.72 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  33.58 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  31.84 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  32.51 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.62 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  31.26 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.13 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.04 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.6 
 
 		 391 aa  170  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  31.1 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.5 
 
 		 658 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  31.21 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  32.85 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.08 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.54 
 
 		 656 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.28 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.7 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.24 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  31.82 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.7 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.47 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30 
 
 		 642 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.79 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.63 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  30.96 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  28.13 
 
 		 652 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.84 
 
 		 647 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.12 
 
 		 401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.67 
 
 		 657 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.78 
 
 		 644 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.05 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.21 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.81 
 
 		 651 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.97 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.6 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.6 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  29.72 
 
 		 657 aa  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  28.31 
 
 		 404 aa  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.45 
 
 		 682 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.45 
 
 		 667 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.45 
 
 		 682 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  30.81 
 
 		 652 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.76 
 
 		 643 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.16 
 
 		 648 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  29.74 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.16 
 
 		 648 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  29.21 
 
 		 656 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.12 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.15 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.4 
 
 		 647 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.22 
 
 		 667 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.12 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.12 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.64 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.44 
 
 		 656 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  28.27 
 
 		 657 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.28 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  30.02 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.57 
 
 		 641 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29.51 
 
 		 678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.22 
 
 		 649 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.51 
 
 		 678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  27.5 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.88 
 
 		 696 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.51 
 
 		 678 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 643 aa  147  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>