56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2215 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  100 
 
 
362 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
360 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
361 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  34.8 
 
 
361 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  32.21 
 
 
372 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  31.71 
 
 
372 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  35.31 
 
 
349 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  35.14 
 
 
362 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  35.65 
 
 
359 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  27.67 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  26.53 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  24.2 
 
 
459 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  23.06 
 
 
495 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.48 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  25 
 
 
760 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  23.08 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  23.4 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  25.78 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  25.97 
 
 
373 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.82 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  27.97 
 
 
286 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  24.47 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  29.94 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  33.33 
 
 
405 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.94 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  21.59 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  32.52 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  26.35 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  23.27 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  28.85 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  22.48 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  23.56 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  28.47 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  28.47 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.45 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  25 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  30.51 
 
 
180 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  24.57 
 
 
409 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.84 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  30.43 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.17 
 
 
325 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  23.74 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>