More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1345 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
532 aa  1090    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  48.44 
 
 
546 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.87 
 
 
526 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 
527 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 
523 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
551 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 
551 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 
523 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
526 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.47 
 
 
461 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
567 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.59 
 
 
525 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.41 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 
559 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
582 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
528 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.98 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
603 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
548 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
529 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
566 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
559 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.21 
 
 
591 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
545 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
556 aa  226  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
543 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  31.71 
 
 
545 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
533 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
543 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 
546 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
582 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
519 aa  223  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.64 
 
 
585 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.53 
 
 
557 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 
559 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  31.75 
 
 
543 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.53 
 
 
520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 
557 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 
573 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
536 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
546 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
557 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
537 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
583 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
537 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.42 
 
 
495 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 
520 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
564 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
554 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
579 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
524 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
540 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.99 
 
 
517 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.15 
 
 
640 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
542 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
539 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
574 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
522 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
579 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.42 
 
 
551 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  30.59 
 
 
609 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.99 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.99 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
600 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
573 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.71 
 
 
560 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.08 
 
 
532 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.71 
 
 
560 aa  200  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.71 
 
 
560 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.71 
 
 
560 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.71 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.71 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.71 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 
560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.06 
 
 
502 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  33.46 
 
 
585 aa  198  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
557 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.01 
 
 
700 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.81 
 
 
502 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
582 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 
557 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
552 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
577 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
579 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
578 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>