More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0052 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
383 aa  762    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  57.97 
 
 
382 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  57.97 
 
 
382 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  56.59 
 
 
382 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  57.85 
 
 
379 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  43.1 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  39.15 
 
 
424 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 
424 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  34.85 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  39.94 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  40.51 
 
 
411 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  37.6 
 
 
425 aa  229  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.72 
 
 
464 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 
434 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  40.52 
 
 
441 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 
434 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 
464 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 
434 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.43 
 
 
422 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 
422 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 
434 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 
434 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  37.99 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.54 
 
 
434 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.17 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 
457 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 
408 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 
425 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 
425 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 
436 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 
436 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 
422 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 
425 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  30.25 
 
 
418 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 
418 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  35.07 
 
 
340 aa  192  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.18 
 
 
429 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  31.01 
 
 
429 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 
459 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 
442 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 
428 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 
426 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 
443 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  30.45 
 
 
428 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 
428 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
419 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 
428 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 
432 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 
416 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 
424 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 
446 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 
420 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
432 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  31.09 
 
 
418 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  31.1 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 
438 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 
418 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 
442 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 
434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  30.31 
 
 
434 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 
438 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 
425 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 
439 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.09 
 
 
428 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
428 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 
443 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 
418 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
428 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 
434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 
425 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 
425 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 
430 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.67 
 
 
432 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 
432 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 
447 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  36.93 
 
 
450 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  31.56 
 
 
432 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 
436 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 
443 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.04 
 
 
419 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>