More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2199 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  66.67 
 
 		 562 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  66.48 
 
 		 562 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  90.26 
 
 		 544 aa  952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  58.96 
 
 		 551 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  66.17 
 
 		 539 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 538 aa  1062    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  60.6 
 
 		 547 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  59.62 
 
 		 543 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  59.89 
 
 		 543 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  58.9 
 
 		 576 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  58.23 
 
 		 539 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  58.26 
 
 		 539 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  57.88 
 
 		 539 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  58.26 
 
 		 539 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  58.07 
 
 		 539 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  58.44 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  58.44 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  57.3 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  58.4 
 
 		 532 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  57.43 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  57.43 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  56.88 
 
 		 541 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  57.17 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  56.61 
 
 		 553 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  53.76 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  52.79 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  53.92 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  52.87 
 
 		 535 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  50.19 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  45.67 
 
 		 576 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  46.13 
 
 		 595 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  48.47 
 
 		 526 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 		 603 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  44.28 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  44.63 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 552 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 		 567 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 609 aa  334  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 616 aa  332  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 		 548 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 547 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  41.49 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.69 
 
 		 572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.5 
 
 		 572 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  36.04 
 
 		 586 aa  325  9e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  35.32 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  41.11 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  38.55 
 
 		 584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  36.76 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  35.13 
 
 		 572 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  39.32 
 
 		 587 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.15 
 
 		 557 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.49 
 
 		 568 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.49 
 
 		 568 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 551 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  36.03 
 
 		 571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  41.15 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  38.85 
 
 		 607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 		 557 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  39.08 
 
 		 588 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  39.08 
 
 		 588 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  34.85 
 
 		 571 aa  309  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  34.79 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  39.23 
 
 		 556 aa  307  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 555 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 555 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 563 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.28 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>