More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0489 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  44.87 
 
 		 1164 aa  737    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  65.24 
 
 		 1147 aa  1272    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  65.03 
 
 		 1165 aa  1246    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  34.3 
 
 		 1155 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  40.21 
 
 		 1182 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  41.86 
 
 		 1180 aa  693    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  65.68 
 
 		 1147 aa  1311    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  40.79 
 
 		 1180 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  41.69 
 
 		 1180 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  40.56 
 
 		 1202 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  42.05 
 
 		 1156 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  86.16 
 
 		 1157 aa  1803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  42.66 
 
 		 1161 aa  700    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  42.06 
 
 		 1161 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  41.97 
 
 		 1164 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  40.87 
 
 		 1189 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  42.27 
 
 		 1159 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  42.26 
 
 		 1162 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  44.8 
 
 		 1151 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  100 
 
 		 1157 aa  2228    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  43.27 
 
 		 1156 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  65.24 
 
 		 1147 aa  1271    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  39.43 
 
 		 1183 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  40.07 
 
 		 1177 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  38.68 
 
 		 1183 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  40.5 
 
 		 1157 aa  597  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  40.31 
 
 		 1187 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  42.06 
 
 		 1167 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  39.26 
 
 		 1185 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  37.44 
 
 		 1125 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  37.53 
 
 		 1120 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  36.44 
 
 		 1121 aa  505  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  38.03 
 
 		 1124 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.77 
 
 		 1183 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  38.97 
 
 		 1119 aa  479  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  38.53 
 
 		 1106 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  36.83 
 
 		 1161 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  38.78 
 
 		 1142 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  36.45 
 
 		 1166 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  39.78 
 
 		 1106 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  27.89 
 
 		 1089 aa  395  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 854 aa  335  3e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.44 
 
 		 860 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  32.01 
 
 		 1147 aa  273  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 1173 aa  189  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1177 aa  183  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1173 aa  182  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  30.4 
 
 		 1087 aa  181  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 1168 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1057 aa  172  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 1173 aa  167  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 1095 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.29 
 
 		 1197 aa  158  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.61 
 
 		 907 aa  152  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 1162 aa  152  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 1103 aa  149  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.89 
 
 		 1251 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 1101 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1140 aa  144  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 1117 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  53.08 
 
 		 1157 aa  135  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  28.22 
 
 		 1187 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1240 aa  126  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 		 1185 aa  125  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.5 
 
 		 1080 aa  124  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 1115 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.77 
 
 		 1244 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.6 
 
 		 1155 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.76 
 
 		 1089 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.91 
 
 		 1129 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55670  exodeoxyribonuclease V beta chain  28.57 
 
 		 1245 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.80629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 1110 aa  118  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 1107 aa  118  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1165 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.67 
 
 		 1242 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  31.57 
 
 		 1101 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.48 
 
 		 1230 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1061 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 1149 aa  115  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.92 
 
 		 1240 aa  115  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 1121 aa  114  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.76 
 
 		 1086 aa  113  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  21.94 
 
 		 1248 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.79 
 
 		 1282 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.87 
 
 		 1203 aa  110  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 1146 aa  110  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  25.3 
 
 		 1244 aa  110  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 1074 aa  109  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  21.17 
 
 		 1204 aa  109  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 1131 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 1123 aa  108  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.42 
 
 		 725 aa  106  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1076 aa  104  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  25 
 
 		 1392 aa  104  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.49 
 
 		 1320 aa  104  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  22.94 
 
 		 915 aa  103  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  27.66 
 
 		 833 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.4 
 
 		 1155 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.04 
 
 		 1217 aa  103  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.32 
 
 		 1241 aa  102  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>