104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3252 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  81.28 
 
 		 397 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  79.8 
 
 		 397 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  805    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  79.26 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  76.54 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  70.73 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  70.73 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  71.22 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  70.73 
 
 		 401 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  71.22 
 
 		 401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  70.24 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  70.24 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  71.57 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  71.08 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  72.2 
 
 		 401 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  72.86 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  70 
 
 		 401 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  67.97 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  70.73 
 
 		 401 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  70.17 
 
 		 400 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  72.86 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  71.64 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  42.79 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  43.77 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.89 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  43.52 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  39.85 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  42.72 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  40.59 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  41.32 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  35.91 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  23.65 
 
 		 349 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  33.7 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.08 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.64 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  23.4 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.84 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  22.58 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.6 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.6 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.46 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  30.92 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  22.91 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.12 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.63 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.72 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  28.96 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.6 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.84 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.84 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.77 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  25.15 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  22.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.04 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  30.7 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  34.55 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  21.36 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.84 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.08 
 
 		 809 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  27.07 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.61 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  22.61 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.06 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.06 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  22.63 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  35.05 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  30 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  17.59 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  28.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  28.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  23.74 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  27.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.91 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.44 
 
 		 855 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  23.7 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.76 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.26 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  20.05 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  27.52 
 
 		 464 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  24.01 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  29.09 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  29.19 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>