More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2474 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  885    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  66.97 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  66.52 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  63.97 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  63.51 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  60.99 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  54.07 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.3 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  56.74 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  54.95 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  46.19 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  45.09 
 
 		 464 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  44.87 
 
 		 444 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  44.22 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  43.26 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  42.66 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  44.04 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  41.05 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.58 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  35.32 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  39.01 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  39.01 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  36.85 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  33.41 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  36.4 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.35 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  33.41 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.81 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.62 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.33 
 
 		 430 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  22.91 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.93 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.12 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  30.46 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  26.84 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.86 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.42 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.14 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.69 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.38 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.87 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  24.17 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.8 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  30.07 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  24.04 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  26.11 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  28.98 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  28.98 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.38 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.97 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  24.4 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.83 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.41 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.13 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  28.26 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.63 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  28.66 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  28.66 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  27.43 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  23.84 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  27.27 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.32 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.05 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  27.32 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  26.71 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  29.45 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  24.15 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.45 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  29.8 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  28.76 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  29.52 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.57 
 
 		 700 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  23.46 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.27 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.21 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  29.41 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.78 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  28.36 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  24.52 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3208  Pdr/VanB family oxidoreductase  32.21 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  31.61 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  27.04 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  30.43 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  23.47 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  30.36 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  23.29 
 
 		 232 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  26.51 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.36 
 
 		 676 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  24.49 
 
 		 372 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  26.45 
 
 		 316 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.94 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  25.63 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  28.18 
 
 		 360 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  29.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  26.85 
 
 		 350 aa  53.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.82 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>