More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0302 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0302  patatin  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  56.96 
 
 		 346 aa  341  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  66.04 
 
 		 346 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  65.49 
 
 		 330 aa  338  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  57 
 
 		 346 aa  338  9e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  62.45 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  61 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  54.7 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  54 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  53.87 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  51.44 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  51.37 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  49.51 
 
 		 318 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  49.03 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  51.31 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  51.33 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  49.82 
 
 		 358 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  51.67 
 
 		 474 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  51.67 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  51.69 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  51.67 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  51.67 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  51.67 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  48.59 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  49.42 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  49.03 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  50 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  49.6 
 
 		 306 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  49.6 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  49.6 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  49.6 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  49.28 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  51.69 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  51.69 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  52.89 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  48.4 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  44.91 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  44.53 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  41.26 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  44.53 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  38.92 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.42 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.67 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  38.63 
 
 		 346 aa  185  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  39.92 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  36.76 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.07 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  38.22 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  38.22 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  37.84 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  37.45 
 
 		 263 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  37.84 
 
 		 263 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  48.7 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  40.08 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.86 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  54.65 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.5 
 
 		 751 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  36.2 
 
 		 728 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.79 
 
 		 727 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.92 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.4 
 
 		 728 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  39.74 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  45.27 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.66 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  45.27 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.81 
 
 		 813 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  39.16 
 
 		 803 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  39.16 
 
 		 803 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  35.42 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  36.63 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  36.63 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  36.6 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  38.81 
 
 		 803 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  37.15 
 
 		 852 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.02 
 
 		 728 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.02 
 
 		 933 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.02 
 
 		 920 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.88 
 
 		 733 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  38.11 
 
 		 804 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.02 
 
 		 945 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.02 
 
 		 930 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  38.01 
 
 		 796 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  45.36 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.59 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.1 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  43.65 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  37.2 
 
 		 667 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.16 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.16 
 
 		 728 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  45.55 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  37.93 
 
 		 798 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.53 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>