More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2314 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  100 
 
 		 364 aa  749    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  61 
 
 		 367 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  62.78 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  49.56 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  49.43 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  45.64 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.55 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.55 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  46.22 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  45.95 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  42.27 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  43.73 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  45.35 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  45.38 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  44.77 
 
 		 359 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  46.06 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  41.87 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  44.61 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  43.44 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 356 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 356 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  41.94 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  43.22 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.73 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  41.93 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  44.06 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  42.94 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  42.36 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  42.41 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  43.1 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  44.35 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  42.18 
 
 		 354 aa  263  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  42.37 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  40.57 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  43.43 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.19 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  43.8 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  41.6 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.23 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  42 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  41.69 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  42.77 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  42.2 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  40.23 
 
 		 426 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  41.4 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  44.16 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 408 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  42.33 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.97 
 
 		 409 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  42.05 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  40.45 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  40.7 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  41.09 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 354 aa  246  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  39.37 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  40.52 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  42.17 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  38.97 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  38.95 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  40.97 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  41.76 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  40.97 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  40.97 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  40.97 
 
 		 351 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  40.97 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  40 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  40.23 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>