More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0207 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  100 
 
 
313 aa  647    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  55.06 
 
 
313 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.16 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
315 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  38.46 
 
 
332 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.97 
 
 
302 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
308 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
306 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
310 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 
337 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.75 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  32.9 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  31.03 
 
 
350 aa  108  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
242 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.41 
 
 
241 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
330 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
329 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 
321 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
308 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  33.96 
 
 
237 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
1171 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  30.96 
 
 
334 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
234 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
334 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
303 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
313 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  27.73 
 
 
255 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  25 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.45 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.36 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.4 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.59 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.41 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.43 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>