49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  100 
 
 
423 aa  832  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  50.59 
 
 
419 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  49.88 
 
 
428 aa  405  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  50.24 
 
 
428 aa  401  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.76334e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  50.24 
 
 
433 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  48.77 
 
 
420 aa  379  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  46.27 
 
 
421 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  42.13 
 
 
421 aa  327  2e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  42.2 
 
 
421 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  40.51 
 
 
396 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  40.73 
 
 
421 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  40.14 
 
 
425 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  41.98 
 
 
422 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  41.12 
 
 
428 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  41.28 
 
 
424 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  40.69 
 
 
424 aa  287  3e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  40.69 
 
 
424 aa  286  3e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  40.38 
 
 
428 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  40.14 
 
 
428 aa  286  6e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  40.45 
 
 
424 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  40.94 
 
 
424 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  40.2 
 
 
424 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  40.21 
 
 
382 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  41.44 
 
 
422 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  34.71 
 
 
421 aa  253  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.93 
 
 
436 aa  245  1e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  34.88 
 
 
434 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  40.59 
 
 
452 aa  234  2e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  34.05 
 
 
437 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  33.81 
 
 
437 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  34.99 
 
 
434 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  34.75 
 
 
434 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  32.78 
 
 
427 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  33.1 
 
 
435 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  34.97 
 
 
418 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  36.24 
 
 
433 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  33.57 
 
 
431 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  35.34 
 
 
422 aa  196  5e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  34.98 
 
 
460 aa  183  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.03 
 
 
429 aa  75.5  2e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  21.4 
 
 
427 aa  57  7e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.6 
 
 
442 aa  55.5  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.93 
 
 
433 aa  53.9  5e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  21.07 
 
 
415 aa  50.4  6e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.49 
 
 
468 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.36 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  58.54 
 
 
52 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  23.53 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>