231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4483 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  100 
 
 
306 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  58.5 
 
 
311 aa  310  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  57.99 
 
 
307 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  55.34 
 
 
311 aa  298  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  52.17 
 
 
316 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  51.44 
 
 
317 aa  292  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  53.27 
 
 
308 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  53.75 
 
 
308 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  54.07 
 
 
309 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  51.96 
 
 
308 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  52.6 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  51.8 
 
 
302 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  49.51 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  50.98 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  48.85 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  48.85 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  48.85 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  51.23 
 
 
317 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  51.63 
 
 
306 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  48.38 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  46.38 
 
 
319 aa  261  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  50.82 
 
 
308 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  50.17 
 
 
329 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  48.52 
 
 
308 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  50.49 
 
 
309 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  47.21 
 
 
320 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  40.53 
 
 
305 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  39.87 
 
 
306 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  41.91 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  41.91 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  40.92 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  42.6 
 
 
305 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  41.91 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  39.2 
 
 
305 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  42.12 
 
 
307 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  37.7 
 
 
306 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  40.65 
 
 
310 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  44.48 
 
 
331 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  41.94 
 
 
307 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  44.09 
 
 
307 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  38.71 
 
 
290 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  40.49 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  39.79 
 
 
279 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  31.37 
 
 
333 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  31.32 
 
 
333 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  31.32 
 
 
333 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  38.01 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
286 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  27.85 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  36.88 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  36.1 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  35.66 
 
 
279 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  38.08 
 
 
278 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  36.67 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  38.16 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  34.72 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  35.74 
 
 
323 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.84 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 
996 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  36.86 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.56 
 
 
991 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  25.36 
 
 
271 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.29 
 
 
1001 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.78 
 
 
1001 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
991 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
991 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.14 
 
 
1240 aa  96.3  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  32.14 
 
 
1191 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  33.54 
 
 
975 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.63 
 
 
1004 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.05 
 
 
1013 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27 
 
 
990 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.43 
 
 
993 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.88 
 
 
1003 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0049  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.87 
 
 
1309 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5941  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.56 
 
 
1345 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  30.61 
 
 
1028 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.16 
 
 
1004 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2811  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.89 
 
 
1361 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3887  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.77 
 
 
1309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471061  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.62 
 
 
1006 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4410  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.45 
 
 
1275 aa  89.7  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 
993 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3018  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.09 
 
 
1320 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.09 
 
 
1003 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
1323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
1323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
1323 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2931  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
1323 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.637197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3321  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  31.51 
 
 
1249 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170675  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.09 
 
 
1004 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3301  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.55 
 
 
1309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.621303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4442  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30 
 
 
1310 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2965  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.23 
 
 
1309 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0460419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>