More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3465 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  580  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  57.14 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  55.02 
 
 
296 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  44.78 
 
 
307 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  44.44 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  47.44 
 
 
307 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.88 
 
 
318 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  37.5 
 
 
342 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 
318 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.57 
 
 
318 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  33.66 
 
 
309 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  34.47 
 
 
309 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  36.3 
 
 
312 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  35.83 
 
 
311 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  34.13 
 
 
297 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.69 
 
 
317 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.56 
 
 
310 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  34.25 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  33.11 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  32.55 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.44 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  34.59 
 
 
310 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.54 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  34.72 
 
 
295 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  32.54 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  32.17 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  31.7 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.85 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.24 
 
 
289 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.8 
 
 
307 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  31.61 
 
 
301 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  31.74 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 
333 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.98 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.48 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.56 
 
 
333 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.63 
 
 
299 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.63 
 
 
317 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.87 
 
 
291 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  32.36 
 
 
314 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.45 
 
 
304 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  32.76 
 
 
279 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  33.12 
 
 
317 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.51 
 
 
331 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.93 
 
 
306 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.72 
 
 
320 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.18 
 
 
301 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 
305 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  31.79 
 
 
305 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
305 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.07 
 
 
285 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  33.78 
 
 
305 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
339 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
322 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.86 
 
 
307 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  28.76 
 
 
294 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  31.51 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.94 
 
 
281 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.15 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  31.71 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.45 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.45 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.72 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  32.19 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.64 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  26.33 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  31.71 
 
 
288 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.48 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  30.15 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.26 
 
 
305 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  27.48 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.82 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.33 
 
 
314 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  28.78 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  30.34 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  27.34 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  24.33 
 
 
302 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  24.5 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.18 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.18 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.21 
 
 
308 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  31.42 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>