More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2347 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  64.21 
 
 
305 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  57.39 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  57.39 
 
 
321 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  45.67 
 
 
319 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  46.79 
 
 
301 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  45.02 
 
 
314 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  41.58 
 
 
311 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  41.58 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.13 
 
 
320 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  46.29 
 
 
319 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  40.36 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 
307 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
301 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  44.56 
 
 
316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  34.08 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  36.5 
 
 
297 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  34.57 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  39.01 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  34.66 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  30.93 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  31.45 
 
 
304 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  33.09 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  34.83 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  38.29 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.92 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  32 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  32.08 
 
 
310 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  32.08 
 
 
310 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  35.19 
 
 
310 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  32.07 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
326 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  32.31 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.74 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.74 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.74 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  35.93 
 
 
311 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.77 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.11 
 
 
335 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  34.02 
 
 
295 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.41 
 
 
322 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  35.46 
 
 
303 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  29.93 
 
 
298 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31.49 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.62 
 
 
294 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  36.64 
 
 
298 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.2 
 
 
308 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.2 
 
 
308 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  30.95 
 
 
324 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 
310 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 
310 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  33.59 
 
 
298 aa  99  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  32.53 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.14 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.75 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.63 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  37.24 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  33.56 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  32.63 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  34.52 
 
 
296 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  31.1 
 
 
364 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  34.36 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.87 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.91 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
324 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  32.86 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.19 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.1 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.58 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
299 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.05 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.34 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.39 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  29.43 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.07 
 
 
334 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.21 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.78 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.96 
 
 
310 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  29.14 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  29.72 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>