More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1140 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
247 aa  502  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  82.91 
 
 
253 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  75.41 
 
 
245 aa  384  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  75.85 
 
 
248 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  73.62 
 
 
257 aa  370  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.48 
 
 
357 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.87 
 
 
349 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.61 
 
 
355 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.74 
 
 
357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.99 
 
 
356 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.43 
 
 
357 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.84 
 
 
397 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.51 
 
 
357 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.49 
 
 
376 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.33 
 
 
359 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.16 
 
 
355 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.12 
 
 
355 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  36.67 
 
 
358 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  39.92 
 
 
355 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.66 
 
 
357 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.89 
 
 
354 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.98 
 
 
357 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  39.13 
 
 
393 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.33 
 
 
358 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.12 
 
 
355 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0979  Nucleotidyl transferase  32.97 
 
 
285 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0844681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.11 
 
 
355 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.89 
 
 
354 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.98 
 
 
357 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.7 
 
 
355 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.98 
 
 
357 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  40.62 
 
 
393 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.54 
 
 
355 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
400 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  39.29 
 
 
393 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.55 
 
 
364 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.59 
 
 
355 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
400 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.4 
 
 
356 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.59 
 
 
355 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.42 
 
 
358 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  39.32 
 
 
383 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.77 
 
 
400 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  38.02 
 
 
396 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 
392 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  36.4 
 
 
355 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.36 
 
 
354 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.87 
 
 
344 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 
411 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  34.22 
 
 
328 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
325 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.45 
 
 
411 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
397 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
411 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  38.87 
 
 
402 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  35.1 
 
 
397 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
325 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.47 
 
 
355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 
403 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.61 
 
 
349 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 
411 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.95 
 
 
351 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.62 
 
 
355 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.53 
 
 
358 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  35.78 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
393 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  36.44 
 
 
399 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
401 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
325 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
402 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.99 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.63 
 
 
356 aa  131  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.2 
 
 
405 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.76 
 
 
414 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.4 
 
 
355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
393 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1576  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.6 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0343  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.2 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
384 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  36.32 
 
 
439 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.09 
 
 
393 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
405 aa  125  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.57 
 
 
240 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
243 aa  124  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0044  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.69 
 
 
289 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.11 
 
 
353 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.55 
 
 
393 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  35.32 
 
 
400 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0416  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.8 
 
 
282 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0689134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
331 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0205  nucleotidyl transferase  33.87 
 
 
262 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6321  Nucleotidyl transferase  32.56 
 
 
298 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0448  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.44 
 
 
289 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0493  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.4 
 
 
282 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>