More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0979 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0979  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0844681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.97 
 
 
247 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
245 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  30.74 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  29.89 
 
 
257 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25.83 
 
 
411 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  26.2 
 
 
411 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  29.67 
 
 
402 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.1 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
402 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.81 
 
 
411 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  23.83 
 
 
328 aa  89  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.9 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  28.52 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.12 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.24 
 
 
354 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  24.45 
 
 
414 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
393 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.9 
 
 
355 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.95 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.37 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.53 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.34 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.57 
 
 
397 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.18 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.3 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  26.46 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.2 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  26.05 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  24.06 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.72 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.94 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  42.5 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.12 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.83 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.42 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  46.05 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  46.05 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.9 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.98 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25.88 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.32 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.39 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.47 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  26.47 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.61 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.51 
 
 
392 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  25.1 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.79 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.3 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  25.47 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  37.23 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.11 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  41.77 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.18 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.18 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.17 
 
 
355 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  48.53 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.55 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  37.65 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  40.43 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  41.24 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.78 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.92 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  25.13 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.61 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  23.38 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  24.03 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.87 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.17 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.25 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  28.36 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  28.47 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.01 
 
 
353 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  23.91 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  39.58 
 
 
391 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  39.62 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  28.12 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  27.75 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  26.05 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.24 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>