More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15370 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 
415 aa  848  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  27.25 
 
 
427 aa  174  2e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
440 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
430 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 
548 aa  135  1e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  34.27 
 
 
365 aa  130  4e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
537 aa  129  8e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.6 
 
 
530 aa  109  9e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 
515 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
513 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 
719 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  26.72 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
409 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
538 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
266 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 
411 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 
532 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  34.32 
 
 
185 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 
251 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
533 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 
542 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
535 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 
233 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
292 aa  85.5  1e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 
408 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  3.5636e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 
408 aa  84.7  3e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
302 aa  84.7  3e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 
760 aa  84.3  3e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  33.81 
 
 
546 aa  84.3  4e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
313 aa  84  5e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  43 
 
 
414 aa  83.6  5e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 
517 aa  83.6  6e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.11836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
252 aa  83.6  6e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 
273 aa  83.6  6e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.29156e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 
534 aa  83.6  7e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  49.4 
 
 
318 aa  83.2  8e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
793 aa  82.4  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
146 aa  81.6  2e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
531 aa  82.4  2e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 
544 aa  81.6  2e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
1201 aa  80.9  4e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 
253 aa  80.5  5e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
277 aa  80.1  6e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
773 aa  80.1  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 
259 aa  79.7  8e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.4 
 
 
287 aa  79.7  9e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.93268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 
284 aa  79.3  1e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  41.05 
 
 
255 aa  79  1e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 
531 aa  79.3  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 
306 aa  79.3  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 
519 aa  78.2  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
301 aa  78.6  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
544 aa  79  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  35.21 
 
 
529 aa  78.6  2e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 
779 aa  79  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  35.46 
 
 
529 aa  78.6  2e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
301 aa  78.2  3e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  36.9 
 
 
298 aa  78.2  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
532 aa  77.8  3e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 
312 aa  77.8  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
259 aa  77.4  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 
276 aa  77  6e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.65121e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.62 
 
 
281 aa  77  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 
279 aa  77  6e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  38.27 
 
 
306 aa  76.6  7e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
285 aa  76.6  7e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 
277 aa  76.6  8e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 
287 aa  76.6  8e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
290 aa  76.3  9e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 
291 aa  76.3  9e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 
281 aa  76.3  9e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
355 aa  76.3  1e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.62622e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 
294 aa  76.3  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.85 
 
 
281 aa  76.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.85 
 
 
281 aa  76.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.85 
 
 
281 aa  76.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.85 
 
 
281 aa  76.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 
299 aa  75.9  1e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
275 aa  75.1  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.08 
 
 
292 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.08 
 
 
292 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 
292 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
294 aa  75.1  2e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.08 
 
 
292 aa  75.1  2e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.08 
 
 
309 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  33.08 
 
 
292 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
522 aa  75.1  2e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 
325 aa  75.5  2e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.08 
 
 
292 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 
265 aa  75.5  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
274 aa  75.1  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
291 aa  75.5  2e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 
502 aa  75.1  2e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  33.63 
 
 
299 aa  75.1  2e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>