More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5286 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 459 aa  932    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  52.78 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  66.56 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  66.56 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  65.61 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  45.84 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  65.29 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  44.62 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  44.71 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  44.22 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.89 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  44.3 
 
 		 469 aa  338  8e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  42.48 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.27 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.05 
 
 		 459 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.92 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.1 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  39.91 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  40.7 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  42.07 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  41.59 
 
 		 463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.31 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  40.53 
 
 		 457 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  40.04 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  39.82 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  38.63 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  40.44 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.95 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  41.15 
 
 		 463 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  40.39 
 
 		 455 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.74 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  41.34 
 
 		 458 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  38.89 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  39.78 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  40.88 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  40.61 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  40.09 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.28 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  39.2 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  41.02 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  41.38 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  37.28 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  40.82 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06170  cystathionine beta-synthase, putative  46.89 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.504616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.82 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  38.88 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  39.6 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  39.96 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.58 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.58 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  40.26 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.54 
 
 		 496 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  46.13 
 
 		 332 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  39.61 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  38.83 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  38.83 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  38.39 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  38.61 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  38.83 
 
 		 464 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  40.71 
 
 		 461 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.91 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.11 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  39.76 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  39.01 
 
 		 464 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  35.54 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  40 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 312 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  39.31 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 312 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  41.85 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  43.71 
 
 		 302 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  46.03 
 
 		 302 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  46.2 
 
 		 327 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.9 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  42.68 
 
 		 355 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.37 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.76 
 
 		 333 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.52 
 
 		 326 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  45.63 
 
 		 317 aa  247  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.95 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.56 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  42.02 
 
 		 315 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  44.55 
 
 		 315 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  44.59 
 
 		 311 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  45.02 
 
 		 316 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  43.75 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  43.52 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  41.45 
 
 		 304 aa  243  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  48.01 
 
 		 306 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  44.7 
 
 		 302 aa  243  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.89 
 
 		 310 aa  243  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  45.95 
 
 		 309 aa  243  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.89 
 
 		 310 aa  243  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  42.06 
 
 		 340 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  46.56 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  44.22 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  42.39 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.39 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>