154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0027 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  100 
 
 
312 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  39.25 
 
 
281 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  39.73 
 
 
279 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  38.36 
 
 
280 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  38.36 
 
 
280 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  39.04 
 
 
280 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  39.25 
 
 
280 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  38.7 
 
 
280 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  38.36 
 
 
280 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  38.36 
 
 
280 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  38.01 
 
 
280 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  38.83 
 
 
280 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  38.83 
 
 
280 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  38.36 
 
 
280 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  38.14 
 
 
280 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  38.49 
 
 
280 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  37.33 
 
 
279 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  36.99 
 
 
280 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  40.66 
 
 
285 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  40.06 
 
 
302 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  41.11 
 
 
286 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  36.64 
 
 
305 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  39.86 
 
 
280 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  40.28 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  42.45 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  40.88 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  36.64 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  38.95 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  40.29 
 
 
285 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  39.49 
 
 
280 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  36.64 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  40.15 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  38.63 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  39.93 
 
 
285 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  34.59 
 
 
290 aa  195  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  39.93 
 
 
285 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  42.86 
 
 
285 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  40.59 
 
 
293 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  36.73 
 
 
284 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  37.24 
 
 
281 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  38.75 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  38.28 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  38.41 
 
 
289 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  38.41 
 
 
278 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  39.1 
 
 
278 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  39.1 
 
 
278 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  35.99 
 
 
282 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  38.41 
 
 
278 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  44.27 
 
 
275 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  37.86 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  37.86 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  38.46 
 
 
280 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  37.86 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  38.78 
 
 
285 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  39.86 
 
 
287 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  36.5 
 
 
285 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  36.9 
 
 
289 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  40.26 
 
 
293 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  37.86 
 
 
281 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  35.35 
 
 
288 aa  186  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  38.75 
 
 
283 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  39.51 
 
 
285 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  39.45 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  36.21 
 
 
281 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  39.45 
 
 
278 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  35.61 
 
 
279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  40.93 
 
 
278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.13 
 
 
280 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  38.61 
 
 
286 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  41.18 
 
 
282 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  41.31 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  35.71 
 
 
284 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  37.41 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  40.61 
 
 
282 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  39.1 
 
 
281 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  38.41 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  36.2 
 
 
280 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2040  hypothetical protein  35.89 
 
 
304 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4055  hypothetical protein  37.88 
 
 
299 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1916  hypothetical protein  35.54 
 
 
301 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0874325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  36.14 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0503  hypothetical protein  35.54 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  41.26 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  40.15 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  36.07 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0874  hypothetical protein  35.19 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  35.19 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0920  hypothetical protein  35.19 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>