117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0299 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0299  transcriptional regulator NikR, CopG family  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.345818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  68.55 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  40.46 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  40.46 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  39.69 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  39.69 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  39.69 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  38.93 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  39.55 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  35.07 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0474  nickel responsive regulator  38.4 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2743  CopG family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00281756  hitchhiker  0.00032337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  33.33 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  36.8 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  36.8 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  35.11 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0210  transcriptional regulator NikR, CopG family  33.07 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3231  nickel responsive regulator  36 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.758254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1135  putative transcriptional regulator, CopG family  32.79 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.548865 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0934  nickel responsive regulator  33.59 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  31.5 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2980  nickel responsive regulator  35.16 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2218  nickel responsive regulator  32.58 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0455847  hitchhiker  0.00550238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1674  nickel-responsive regulator  31.62 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.750347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0772  nickel responsive regulator  35.16 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3645  CopG family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  35.48 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  29.77 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0494  nickel responsive regulator  32.81 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  32.06 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  29.1 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1371  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.37 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1953  nickel responsive regulator  33.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1855  CopG family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3075  transcriptional regulator NikR, CopG family  33.58 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.251737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2090  nickel responsive regulator  32.28 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000414666  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2214  transcriptional regulator NikR, CopG family  33.86 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3628  nickel responsive regulator  33.07 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1397  putative transcriptional regulator, CopG family  34.11 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.640554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3562  nickel responsive regulator  33.07 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0911  transcriptional regulator NikR, CopG family  32.17 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3086  putative transcriptional regulator, CopG family  32.76 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.817448  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0609  CopG family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  27.91 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  29.46 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0269  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.57 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00550  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and metal-binding domain  29.13 
 
 		 172 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0327438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3947  nickel responsive regulator  29.1 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0076  CopG family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.23 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0530  nickel responsive regulator  32.56 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0440783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0795  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.15 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1897  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0525  nickel responsive regulator  32.56 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.317174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0497  nickel responsive regulator  31.78 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2067  putative transcriptional regulator, CopG family  29.57 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391455  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3543  putative transcriptional regulator, CopG family  28.46 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2765  nickel responsive regulator  32.33 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.648121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3111  nickel responsive regulator  27.69 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1234  nickel responsive regulator  25.98 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2008  CopG family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3104  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4027  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.23 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2747  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.23 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0271  transcriptional regulator NikR, CopG family  28.46 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1236  CopG family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2805  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0220  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.82 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4927  transcriptional regulator NikR, CopG family  27.69 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00610  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  28.36 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4446  CopG family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5239  nickel responsive regulator  29.55 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3039  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4064  CopG family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.516784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2412  nickel responsive regulator  29.55 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0049093  normal  0.0222031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3341  nickel responsive regulator  34.35 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.370359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3004  nickel responsive regulator  34.35 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0411  CopG family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.629331  normal  0.0285278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6191  CopG family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7612  nickel responsive regulator  26.92 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0039  CopG family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1789  CopG family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0805  nickel responsive regulator  24.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.822913  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0755  nickel responsive regulator  24.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1656  CopG family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0193  CopG family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.272405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1839  nickel responsive regulator  34.55 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.442629  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0420  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.66 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1563  CopG family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3853  nickel responsive regulator  36.59 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3786  nickel responsive regulator  36.59 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>