96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1656 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1656  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0911  transcriptional regulator NikR, CopG family  33.33 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3104  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.78 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  30 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  30.71 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  30 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  30 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0269  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.6 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  29.23 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2067  putative transcriptional regulator, CopG family  31.2 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391455  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  23.62 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  27.48 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2743  CopG family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00281756  hitchhiker  0.00032337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1135  putative transcriptional regulator, CopG family  31.86 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.548865 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1897  transcriptional regulator NikR, CopG family  28.8 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  27.42 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3947  nickel responsive regulator  26.77 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  30.7 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7612  nickel responsive regulator  30.09 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3004  nickel responsive regulator  26.23 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  31.19 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3341  nickel responsive regulator  25.41 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.370359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.36 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2214  transcriptional regulator NikR, CopG family  23.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1234  nickel responsive regulator  27.52 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  29.27 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0210  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.68 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2805  nickel responsive regulator  28.85 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0271  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.69 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0772  nickel responsive regulator  30.47 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2747  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.44 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3111  nickel responsive regulator  29.73 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0474  nickel responsive regulator  28.46 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1953  nickel responsive regulator  28.85 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0494  nickel responsive regulator  28.12 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0220  transcriptional regulator NikR, CopG family  27.52 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  27.56 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2218  nickel responsive regulator  25.4 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0455847  hitchhiker  0.00550238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0530  nickel responsive regulator  30.47 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0440783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5239  nickel responsive regulator  27.43 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  28.46 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3562  nickel responsive regulator  28.91 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  29.25 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3231  nickel responsive regulator  29.52 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.758254  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0193  CopG family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.272405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2980  nickel responsive regulator  28.12 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3543  putative transcriptional regulator, CopG family  25 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0525  nickel responsive regulator  29.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.317174  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1305  CopG family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.145448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4027  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.09 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3628  nickel responsive regulator  28.91 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0497  nickel responsive regulator  29.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  26.83 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3039  nickel responsive regulator  25.69 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1855  CopG family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4927  transcriptional regulator NikR, CopG family  23.81 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2090  nickel responsive regulator  27.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000414666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6191  CopG family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  26.36 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00550  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and metal-binding domain  27.93 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0327438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0411  CopG family transcriptional regulator  25 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.629331  normal  0.0285278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0420  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.18 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1012  CopG family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.632842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1371  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.61 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1563  CopG family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2412  nickel responsive regulator  25.93 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0049093  normal  0.0222031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2765  nickel responsive regulator  25 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.648121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  30.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  23.58 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0795  transcriptional regulator NikR, CopG family  30 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.96 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2008  CopG family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0076  CopG family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 151 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1674  nickel-responsive regulator  25.58 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.750347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0755  nickel responsive regulator  23.68 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0805  nickel responsive regulator  23.68 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.822913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0977  CopG family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0917011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03283  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4821  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3840  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0235  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03330  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3965  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3680  nickel responsive regulator  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0234  putative transcriptional regulator, CopG family  32.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4064  CopG family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 147 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.516784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3765  nickel responsive regulator  29.9 
 
 		 133 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>