90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0165 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  75.56 
 
 		 135 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0977  CopG family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0917011  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  31.01 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  30.77 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  30.77 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  30 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  30.47 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  33.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00610  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  31.78 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3075  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.75 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.251737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  33.87 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00550  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and metal-binding domain  28.03 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0327438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0934  nickel responsive regulator  26.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2743  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00281756  hitchhiker  0.00032337 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  29.13 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  28.8 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0076  CopG family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1897  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.93 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1371  transcriptional regulator NikR, CopG family  32.54 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  29.92 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  28.93 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0911  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.66 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  26.02 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3104  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.51 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0609  CopG family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2214  transcriptional regulator NikR, CopG family  28.69 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  28.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0269  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.25 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  27.78 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0039  CopG family transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  24 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0420  transcriptional regulator NikR, CopG family  22.96 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1855  CopG family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3562  nickel responsive regulator  25.19 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  23.77 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2067  putative transcriptional regulator, CopG family  28.57 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391455  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3628  nickel responsive regulator  25.56 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4446  CopG family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0772  nickel responsive regulator  23.66 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2980  nickel responsive regulator  24.06 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1397  putative transcriptional regulator, CopG family  27.64 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.640554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0474  nickel responsive regulator  26.02 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2218  nickel responsive regulator  21.8 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0455847  hitchhiker  0.00550238 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4027  transcriptional regulator NikR, CopG family  23.39 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  27.61 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3039  nickel responsive regulator  20.61 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7612  nickel responsive regulator  25.41 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0795  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  27.34 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0805  nickel responsive regulator  25.2 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.822913  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0755  nickel responsive regulator  25.2 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2747  transcriptional regulator NikR, CopG family  21.77 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3086  putative transcriptional regulator, CopG family  24.32 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.817448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1135  putative transcriptional regulator, CopG family  21.97 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.548865 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1656  CopG family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0299  transcriptional regulator NikR, CopG family  25 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.345818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  24.46 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5239  nickel responsive regulator  19.85 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2412  nickel responsive regulator  20.61 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0049093  normal  0.0222031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2090  nickel responsive regulator  22.56 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000414666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1674  nickel-responsive regulator  23.14 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.750347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0210  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.8 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1236  CopG family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3004  nickel responsive regulator  23.53 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0494  nickel responsive regulator  22.56 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  21.37 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3341  nickel responsive regulator  22.69 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.370359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2765  nickel responsive regulator  22.83 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.648121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0530  nickel responsive regulator  24.44 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0440783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0497  nickel responsive regulator  23.7 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0525  nickel responsive regulator  24.44 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.317174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3231  nickel responsive regulator  23.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.758254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4064  CopG family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.516784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  23.58 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3645  CopG family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3947  nickel responsive regulator  22.22 
 
 		 154 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3543  putative transcriptional regulator, CopG family  22.13 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2008  CopG family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  35.29 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  40.91 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  38.1 
 
 		 104 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>