56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0420 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0420  transcriptional regulator NikR, CopG family  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2214  transcriptional regulator NikR, CopG family  51.61 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3104  transcriptional regulator NikR, CopG family  49.04 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0269  transcriptional regulator NikR, CopG family  47.8 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0911  transcriptional regulator NikR, CopG family  46.88 
 
 		 142 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2067  putative transcriptional regulator, CopG family  48.39 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391455  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1897  transcriptional regulator NikR, CopG family  45.45 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  29.55 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  32.95 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  28.41 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  28.41 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  28.41 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  32.97 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  30.68 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0474  nickel responsive regulator  30.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  25 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  25 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  29.55 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2008  CopG family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0076  CopG family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3004  nickel responsive regulator  29.79 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3341  nickel responsive regulator  29.79 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.370359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0210  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.76 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0795  transcriptional regulator NikR, CopG family  27.27 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1656  CopG family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1953  nickel responsive regulator  34.04 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  29.21 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3231  nickel responsive regulator  26.74 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.758254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1855  CopG family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  23.4 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2805  nickel responsive regulator  27.47 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0977  CopG family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0917011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  23.66 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4027  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.81 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  28.72 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0609  CopG family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396237  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4927  transcriptional regulator NikR, CopG family  30.43 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0299  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.44 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.345818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  29.21 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3086  putative transcriptional regulator, CopG family  26.14 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.817448  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3543  putative transcriptional regulator, CopG family  29.67 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  23.86 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  27.78 
 
 		 133 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0934  nickel responsive regulator  29.55 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4446  CopG family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  23.91 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1135  putative transcriptional regulator, CopG family  25.27 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.548865 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  27.91 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>