97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0609 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0609  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  318  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4446  CopG family transcriptional regulator  73.61 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0795  transcriptional regulator NikR, CopG family  45.32 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1855  CopG family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3086  putative transcriptional regulator, CopG family  43.66 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.817448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0076  CopG family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  38.52 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  38.52 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  37.78 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  37.78 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1789  CopG family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00610  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00550  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain and metal-binding domain  31.97 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0327438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3075  transcriptional regulator NikR, CopG family  33.82 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.251737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  32.62 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  34.62 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  32.28 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2980  nickel responsive regulator  37.98 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0494  nickel responsive regulator  34.35 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2041  CopG family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000563555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  33.85 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0474  nickel responsive regulator  34.62 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0507  nickel responsive regulator  30.6 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1768  putative transcriptional regulator, CopG family  28.89 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.123509  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1135  putative transcriptional regulator, CopG family  33.33 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.548865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2090  nickel responsive regulator  32.81 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000414666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0772  nickel responsive regulator  33.85 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2743  CopG family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00281756  hitchhiker  0.00032337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0193  nickel responsive regulator  28.79 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0129549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1371  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.13 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.551897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  35.77 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0934  nickel responsive regulator  26.52 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3628  nickel responsive regulator  33.33 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3562  nickel responsive regulator  33.33 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0355  nickel responsive regulator  28.99 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000375481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2765  nickel responsive regulator  31.82 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.648121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0662  nickel responsive regulator  30.3 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0229415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1897  nickel responsive regulator  27.54 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0606  putative transcriptional regulator, CopG family  30.53 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.01 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3231  nickel responsive regulator  31.2 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.758254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0525  nickel responsive regulator  33.58 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.317174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2239  CopG family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.849236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0530  nickel responsive regulator  32.84 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0440783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1674  nickel-responsive regulator  27.5 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.750347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0497  nickel responsive regulator  32.09 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1100  NikR nickel binding protein  26.56 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1236  CopG family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0842  CopG family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514267  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1643  CopG family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000269216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3111  nickel responsive regulator  26.52 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3947  nickel responsive regulator  27.56 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2218  nickel responsive regulator  29.01 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0455847  hitchhiker  0.00550238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0193  CopG family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.272405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0164  transcriptional regulator NikR, CopG family  31.97 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.200645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2003  putative transcriptional regulator, CopG family  30.6 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000417208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3039  nickel responsive regulator  27.91 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3645  CopG family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1953  nickel responsive regulator  27.05 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1397  putative transcriptional regulator, CopG family  24.82 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.640554  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2805  nickel responsive regulator  25.95 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0411  CopG family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.629331  normal  0.0285278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0210  transcriptional regulator NikR, CopG family  24.43 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  23.77 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2412  nickel responsive regulator  27.91 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0049093  normal  0.0222031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2008  CopG family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5239  nickel responsive regulator  27.91 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0299  transcriptional regulator NikR, CopG family  28.69 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.345818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1305  CopG family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.145448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4064  CopG family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.516784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0911  transcriptional regulator NikR, CopG family  23.24 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0755  nickel responsive regulator  25.19 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1234  nickel responsive regulator  25.17 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0805  nickel responsive regulator  25.19 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.822913  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0039  CopG family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3104  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.62 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1897  transcriptional regulator NikR, CopG family  22.86 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2214  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.83 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3543  putative transcriptional regulator, CopG family  26.36 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0269  transcriptional regulator NikR, CopG family  22.5 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2747  transcriptional regulator NikR, CopG family  25.78 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7612  nickel responsive regulator  23.77 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1563  CopG family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6071  CopG family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0977  CopG family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0917011  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4927  transcriptional regulator NikR, CopG family  26.72 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3004  nickel responsive regulator  30.08 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3341  nickel responsive regulator  30.08 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.370359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2067  putative transcriptional regulator, CopG family  23.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391455  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0420  transcriptional regulator NikR, CopG family  29.41 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6191  CopG family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2005  CopG family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>