25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2407 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 62 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  86.89 
 
 		 62 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  74.19 
 
 		 59 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  67.74 
 
 		 59 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0981  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  64.52 
 
 		 59 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0146172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1405  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  60 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000545098  normal  0.171079 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0744  CopG family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.605569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0941  transcriptional regulator  60.47 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119316  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2152  putative transcriptional regulator, CopG family  55 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1448  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 54 aa  42.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0926  putative transcriptional regulator, CopG family  39.02 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2232  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 		 48 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000030214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2021  putative transcriptional regulator, CopG family  42.5 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>