23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1400 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 50 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2232  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  93.48 
 
 		 48 aa  89.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000030214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1182  nickel responsive regulator  42 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0929  nickel responsive regulator  40 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1017  nickel responsive regulator  40 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1664  nickel responsive regulator  40 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  34.88 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  32.56 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1405  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 59 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000545098  normal  0.171079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  46.51 
 
 		 90 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1201  nickel responsive regulator  38 
 
 		 141 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  46.51 
 
 		 90 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>