25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4630 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  47.73 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  42.35 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.34 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.35 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  46.27 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.02 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.26 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.38 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2871  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.27 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117146  normal  0.120105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0780  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.65 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.052112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0941  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119316  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2152  putative transcriptional regulator, CopG family  46.51 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0893  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  53.19 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.548223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.77 
 
 		 87 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  32.95 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.24 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.24 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  32.88 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0165  CopG family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 135 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.518598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 88 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>