16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6567 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 
93 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.78 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  58.06 
 
 
96 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  40.66 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  46.34 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6886  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.22 
 
 
46 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  38.75 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.27 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.48 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  33.75 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0780  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.54 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.052112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  30 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0893  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  41.07 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.548223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  37.31 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  35.82 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>