77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2354 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 		 90 aa  179  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  55.81 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  52.44 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  47.62 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  47.62 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.19 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.19 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.19 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.17 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.61 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  54.93 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  54.93 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.74 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  54.1 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.12 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.61 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  40.79 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  53.23 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.37 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.82 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.9 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  49.21 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  49.18 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.84 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.13 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.68 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  49.21 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.71 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.58 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  37.18 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  39.24 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.24 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  45.61 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  37.18 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2910  transcriptional regulator  50 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.206676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  40.51 
 
 		 86 aa  48.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  45.9 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.14 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.14 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  52.17 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  46.48 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  46.48 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  46.48 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  46.48 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  56.76 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  46.48 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  61.29 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  40.91 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  31.03 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  37.88 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.25 
 
 		 91 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  43.66 
 
 		 95 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3609  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  29.41 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2505  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  29.41 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.82 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>