60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2586 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 
80 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  87.69 
 
 
82 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  60.81 
 
 
83 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  57.14 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  53.25 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  62.5 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.5 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.3 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  58.73 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  57.38 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  57.14 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.42 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  57.81 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  57.38 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.74 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.44 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  55.74 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  54.1 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  43.04 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  44.16 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  44.16 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.56 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.36 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.36 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  52.38 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  50.85 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.37 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  38.96 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.28 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.08 
 
 
88 aa  53.9  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  47.46 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  47.46 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.46 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.46 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.46 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.12 
 
 
82 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  40.35 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.83 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  46.75 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1103  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.04 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.51 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  41.33 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.62 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  38.1 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.43 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  29.41 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.45 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  36.25 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  42.86 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  39.06 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  36.9 
 
 
86 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  30.88 
 
 
84 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.33 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  37.66 
 
 
83 aa  40.8  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.07 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  37.74 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.1 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>