81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0986 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 
83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  67.95 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  67.11 
 
 
81 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  67.11 
 
 
81 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  69.33 
 
 
82 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  68 
 
 
82 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  65 
 
 
81 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  69.33 
 
 
82 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  69.33 
 
 
82 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  60.81 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  60.76 
 
 
83 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  61.64 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.46 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.5 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  59.46 
 
 
80 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  58.67 
 
 
83 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  61.11 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  67.19 
 
 
82 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  50.67 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  50 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  64.38 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  49.33 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  55.22 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  55.74 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  55.74 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  64.18 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  49.3 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  55.93 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  54.1 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  44.16 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.9 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.9 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  45.95 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  45.95 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  45.95 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  54.24 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  54.24 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  44.59 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.32 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.32 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.32 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  44.59 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  45.33 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50 
 
 
88 aa  57.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  41.79 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.54 
 
 
86 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  41.89 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  43.86 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.14 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  54.35 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.28 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.19 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  37.5 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  44.9 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.37 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1170  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.67 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154288  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1650  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.67 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.63 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  35.06 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.45 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  36.21 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1103  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.29 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.305268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  50 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  36.71 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  30.56 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.5 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  37.04 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  35.14 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  38.89 
 
 
83 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.67 
 
 
63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5686  hypothetical protein  39.39 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.89 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.51 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0099  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.62 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  39.39 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  32.81 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  42.31 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  33.93 
 
 
97 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4905  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>