58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6482 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  71.08 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  58.67 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.03 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  46.99 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  36.59 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  36.59 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  50 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  33.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  38.1 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  38.1 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.24 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.24 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.24 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.08 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.62 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.07 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.07 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  35.53 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  42.31 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.8 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.38 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  42.31 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.31 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.57 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  37.7 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  37.7 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.31 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  37.7 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  36.07 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  36.07 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  36.54 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  42.31 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.93 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  41.51 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.24 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  34.43 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  42.86 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.71 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.59 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  47.62 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45 
 
 		 64 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  35.82 
 
 		 96 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>