61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1628 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 
82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  49.33 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  48.15 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.59 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.36 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.12 
 
 
81 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.62 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.12 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.03 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.24 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  42.86 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  42.86 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.85 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  51.85 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  62.16 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  44.62 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.55 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.55 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.55 
 
 
87 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.44 
 
 
82 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  44.62 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  47.46 
 
 
85 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  40.91 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.55 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  44 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  52.63 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.81 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  41.18 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  36.49 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  38.96 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  39.74 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.14 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.12 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.12 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.12 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.12 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.03 
 
 
82 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  44.23 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4906  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  32 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  41.33 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.5 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4793  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.89 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  42.11 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2910  transcriptional regulator  38.46 
 
 
84 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.206676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.14 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.19 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.35 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.19 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  34.48 
 
 
84 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  36.25 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.78 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  31.17 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.132948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>