91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2215 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.78 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.58 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.44 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.44 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.74 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2871  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.12 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117146  normal  0.120105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.15 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.48 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.21 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.47 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.56 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  38.96 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  48.44 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  48.44 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  48.44 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  47.62 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  47.62 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.18 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.04 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2910  transcriptional regulator  60 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.206676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  43.04 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  35.37 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.28 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.69 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  46.77 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  34.18 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  38.46 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.75 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  46.03 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.71 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.71 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  40 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  40 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  39.39 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.19 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.71 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  46.15 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  32.14 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  39.39 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  32.14 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  38.6 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  43.55 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  43.55 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  37.97 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  32.1 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  37.7 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.85 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.31 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.31 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.31 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  29.76 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  44.64 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.06 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.4 
 
 		 92 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.4 
 
 		 92 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  52.5 
 
 		 80 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  36.07 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.43 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  38.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  37.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.06 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>