29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1995 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.5 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  56.63 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  64.62 
 
 		 155 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  57.89 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  57.89 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  57.89 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  57.89 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  57.89 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  57.89 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  57.89 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45.31 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.82 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  38.81 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.81 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  47.92 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2093  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267606  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 86 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.73 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  43.24 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  52.5 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  39.13 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  28.24 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>