41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1025 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 90 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  65 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  42.65 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4866  hypothetical protein  42.03 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7215  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.78 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.132948 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6567  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.27 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563627  normal  0.497658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2013  CopG family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  43.28 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.56 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  55.56 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  39.47 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  44.44 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0893  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  40.28 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.548223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  32.53 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0780  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.44 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.052112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.54 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1405  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 59 aa  42  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000545098  normal  0.171079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  34.72 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  40.62 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5222  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  50 
 
 		 63 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  40.62 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  40.62 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  40.62 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  40.62 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  47.5 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  32.53 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  31.94 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  31.94 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2152  putative transcriptional regulator, CopG family  41.86 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.48 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.48 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>