23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5111 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  64.62 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  64.62 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  60.61 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  62.69 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  57.14 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  49.15 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  49.15 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  49.15 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  49.15 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.89 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  34.25 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 86 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.5 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  41.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.23 
 
 		 81 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>