27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2291 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  90.91 
 
 		 89 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 89 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 89 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.09 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.09 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 82 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  61.11 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  55.13 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  55.13 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  55.13 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  55.13 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  55.13 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  55.13 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  55.13 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  58.21 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15560  hypothetical protein  79.41 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000160918  unclonable  2.1203199999999998e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.7 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 239 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45.61 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  34.88 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  34.52 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2093  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267606  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0870  nickel-responsive regulator  40.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  40 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4630  hypothetical protein  34.78 
 
 		 104 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>