41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0774 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 
64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5111  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  57.14 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128076  normal  0.0578974 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5390  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  50.91 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1995  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.31 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0305  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.31 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.37 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.61 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  47.37 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1220  hypothetical protein  44 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1569  KluA  44 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000021473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0064  hypothetical protein  44 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000734159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0076  hypothetical protein  44 
 
 
86 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000349525  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0075  KluA  44 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0093  hypothetical protein  44 
 
 
86 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1503  hypothetical protein  44 
 
 
86 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000588383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  52.73 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.44 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2980  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  54.76 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0334789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.84 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  48.84 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.08 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  40 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  48.08 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.51 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  47.5 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.19 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  44.19 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  45.45 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.51 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  46.51 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.84 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  46.34 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.92 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  44.19 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  44.19 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  65.52 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  44.9 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.48 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45 
 
 
88 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>