36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0700 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  37.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  37.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  43.84 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  39.44 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.03 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  35.53 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  35.53 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  39.44 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  41.54 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  35.53 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.78 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5227  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  43.18 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.03 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.62 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.43 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  40.62 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.62 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.66 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  43.75 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  33.82 
 
 		 87 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 81 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  33.82 
 
 		 87 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  38.16 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  38.16 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  29.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  36.07 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  36.07 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0774  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.34 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  35.82 
 
 		 89 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>